MS-06E 強行偵察型渣古Ⅱ原本是以MS-06C型為基礎而開發的偵察機。

在本機進行量產時，自護軍的主力MS已由C型改為F型，因此E型主要是在F型的生產線上生產的。

由於大幅度削減了不必要的裝備，使E型的燃料搭載最大限度增加了10%；另外還採用了新型的發動機，使機體的推力大幅度上升；原先裝備在機體右肩的盾牌以及左肩的裝甲都被取消了，而代之攝像機各一架，大腿間也加設了一架攝像機；機體內部還裝有其他的探測系統；此外，本機的胸部裝備了緊急脫離用火箭推進器。

強行偵察型渣古Ⅱ沒有裝備實戰所使用的武器，但可以選裝CE-16TX型攝像槍。 大戰中期以後，本機的塗裝漸由綠色改為低視度的濃灰色，更方便進行偵察工作。

雖然投入戰場的時間比較早，但由於造價相當高，本機只生產了100架左右。

由於性能優良，本機後被聯邦軍接收並配備給了泰坦斯，用於情報收集工作。